
拜谱生物正式推出基于化学蛋白质组学的衣康碱化体现蛋白质组学产品,实现1000+高妙度体现位点排除,可靠再次出现特色靶点,全方面生信具体分析解析靶点蛋白功能信息,发现新靶点,并提供从“发觉”到“认可”全流量售后服务,为深度理解衣康酸及其衍生物在不同疾病研究中的作用机制提供重要依据。
PART 1
01、科学试验标准流程
02、监测的数据
03、经“点”初现
在测试统计资料中,检测很多文章中报到的特色靶点还衣康酸呈现位点,如一款被发觉的衣康酸共价呈现核蛋清KEAP1,还糖酵解通道中的3个要点酶如LDHA、GAPDH、ALDOA,并且炎性小体构成核蛋清NLRP3和上皮细胞损伤整个过程中的要点核蛋清RIPK3等,其质谱图下面的图随时。
04、的产品共同点
1.多厚质控
业务化特女性朋友探头孵育、SDS-PAGE检查、WB验正、样本量重要性性概述等多方面位检查,确定楼盘最终结果可靠的性。2.高特点质谱设备平台网站
在Orbitrap Astral全新新一批高鉴别质谱仪扶持下,确保衣康酸性反应突显位点及淀粉酶鉴定费新深度1,电子助力科学合理研究探讨新会发现。3.全的流程站台式服务于
为拜谱怪物完美的工作网上平台,可带来“神经元塑造→测试探针孵育→WB测试→玄妙度衣康酸性反应淡化测试→专属于生信浅析→不同位点PRM验证通过”全操作流程工作,省时高效更高效。05、介绍网站内容(组成部分)
06、应用大方向
PART 2、学术论文安利
论文一
用英文怎么说主题词:Chemoproteomic profiling of itaconation by bioorthogonal probes in inflammatory macrophages(Journal of the American Chemical Society,Q1,2020)
中文名文章标题:炎症巨噬细胞中生物正交探针的化学蛋白质组学分析
实验东西:本研究首次报道了基于衣康酸类似物OI,设计合成了适用于活细胞标记的衣康酸生物正交探针(ITALK),并实现了对炎症巨噬细胞中衣康酸修饰位点的直接鉴定。共鉴定出862个衣康酸化蛋白、1131个半胱氨酸位点,且存在18个赖氨酸和8个组氨酸的衣康酸修饰。这些修饰底物中包括了许多参与到炎症免疫响应和宿主防御相关调节通路中的关键蛋白,例如炎性小体、信号转导、转录和细胞死亡相关蛋白,暗示衣康酸可通过调节多种通路来影响巨噬细胞功能。作者们选取了几个新发现的修饰蛋白BRI3B、WIPI3和RIPK3并通过点突变实验对其修饰位点进行了验证。本研究为理解衣康酸在巨噬细胞炎症反应中的作用机制提供了丰富的数据支持。
(图源:Qin, Wei et al.,J Am Chem Soc. 2020)
医学文献二
英文字母题头:4-Octyl itaconate restricts STING activation by blocking its palmitoylation(Cell Reports,Q1,2023)
常常题目:4-辛基衣康酸通过阻断STING蛋白棕榈酰化来抑制其活性
理论研究方面:cGAS-STING轴在防御外来病原体和维持免疫稳态中起着至关重要的作用。虽然在了解巨噬细胞活化过程中发生的代谢变化方面已经取得了实质性的进展,但对这些代谢变化如何影响cGAS-STING轴却知之甚少。在这项研究中,作者确定衣康酸的衍生物4-辛基衣康酸(4-OI)抑制cGAS-STING的激活。此外,作者发现4-OI抑制cGAS-STING相关的抗病毒免疫反应和自身免疫性炎症。然而,作者发现内源性衣康酸不影响cGAS-STING激活,表明4-OI和衣康酸的功能不同。从机理上讲,研究发现4-OI直接烷基化STING上的Cys91,阻断STING棕榈酰化和寡聚化。4-OI对STING的烷基化代表了STING的另一种翻译后修饰(PTMs)。该研究的发现揭示了cGAS-STING功能通过4-OI烷基化进行调节的机制,并为不同类型PTMs之间的串扰提供了见解。
(图源:Su, Chaofei et al.,Cell Rep. 2023)
PART 3、案列繁衍工作思路
蛋白质的S-脂酰化(S-acylation)是指脂肪酸与半胱氨酸的巯基通过硫酯键相连。最典型的是棕榈酸,即S-棕榈酰化。催化这一反应的酶属于蛋白质酰基转移酶(protein acyltransferase,PAT)家族,含有DHHC(Asp-His-His-Cys)序列,所以称为DHHC-PAT。由于DHHC基序形成锌指结构域,因此编码这些酶的基因称为含锌指DHHC(zDHHC)。现已发现24种人类zDHHC基因,命名为zDHHC1- 24(无zDHHC10,有zDHHC11B)。这些zDHHC之间的底物亲和力和催化活性差异很大,其中zDHHC17和zDHHC13享有有较强的底物构建特性,而zDHHC3和zDHHC7具有高效的S-酰化作用。
S-棕榈酰化通过两步机制进行(如下图)。第一步是DHHC基序中的半胱氨酸残基被来自棕榈酰-CoA的棕榈酸酰化,形成酰基酶中间体,这一步通常称为自棕榈酰化。第二步是将棕榈酰基部分转移到蛋白质底物中的半胱氨酸巯基上。
(图源:Anderson, Alison M et al.,NPJ Breast Cancer. 2016)
值得一提的是,在拜谱怪物衣康硝化作用修饰语组场地实测的数据中,发现zDHHC13有3个半胱氨酸残基被衣康酸性反应掩盖(如下所示图)。不妨设想,zDHHC13的半胱氨酸残基被衣康酸烷基化,影响其自棕榈酰化,进一步影响其靶蛋白的棕榈酰化,进而影响相应的生物学功能,为相关机制机理研究提供新思路。
PART 4、拜谱总结
用作TCA再循环中的上面分泌率物,衣康酸调准分泌率、免疫细胞检测性和感染之中的互相做用,为方法免疫细胞检测性感染性重大疾病症状供给了代换方法基本思路。衣康酸结构设计设计中的亲电性α,β-不供大于求羧酸结构设计设计能对血清质上的活性氧半胱氨酸残基完成烷基化装饰(迈克尔加强反應),该翻譯后装饰被喻为“衣康酸装饰(itaconation)”,从而决定血清质系统,国家宏观调控免疫细胞检测性回复和分泌率途经,为多种多样重大疾病症状抗癫痫药物开发供给新基本思路。拜谱生物作为国内领先的多组学公司,全新推出基于化学蛋白质组学的衣康过酸遮盖血清组学产品,在全流程高精密仪器和高特异性生物正交探针加持下,可实现高精度、高深度的一站式衣康酸化修饰组检测。另外,可搭配拜谱生物医学研究绝对性按量靶点产生组(QMT1000)或人体脂肪新陈新陈代谢靶点新陈新陈代谢组护肤品对衣康酸及其类似物进行靶向绝对定量检测。多组学强强联手,有助于深入理解衣康酸化修饰的功能及其调控机制,为疾病机制机理研究提供科学依据,从而在指导靶向药物设计、疾病治疗等方面创造无限可能。欢迎咨询!
关联性医学文献
1. Qin W,Zhang Y,Tang H, et al. Chemoproteomic Profiling of Itaconation by Bioorthogonal Probes in Inflammatory Macrophages. J Am Chem Soc. 2020;142 (25):10894-10898. 2. Su C,Cheng T,Huang J, et al. 4-Octyl itaconate restricts STING activation by blocking its palmitoylation. Cell Rep. 2023;42 (9):113040. 3. Anderson AM,Ragan MA. Palmitoylation: a protein S -acylation with implications for breast cancer. NPJ Breast Cancer. 2016;2:16028.